我本人是生态学本科毕业，现在读生态学的研究生。

首先，我觉得你对学科的认识有偏差，环境工程应该说是工科，更多的偏向于实际的应用，对理论的探寻不同于理科，比如，环境科学家往往关心的是环境演变会不会产生河流泥沙堆积的变化，污染物的排放怎么影响河流水质等等，而环境工程学家则更加关心用什么方法可以解决泥沙问题，用什么方法可以处理这些污染，所以环境工程更加偏向应用。对生态学，我更加了解一些，首先，生态学绝对不是文科，那些让你背诵记忆的生态学，不是纯正的生态学，生态学应该说是一门离不开实验的科学（环境科学和换进工程也离不开实验），生态学研究的是生物和环境之间的相互关系的自然科学，应该说，和文科基本没有关系。从不同尺度来说，生态学研究个体，种群，群落，生态系统以及全球生态学问题。你所说的就业问题，我是这么认为的，首先，环境工程是很应用的学科，所以如果做环境工程，比如做水沙治理，污染物治理等等，是可以直接和生产应用结合在一起的，应该说是一个和实际联系紧密的学科，生态学则在近些年很受关注，特别是关于减少碳排放，治理土退化，解决景观尺度的规划和功能问题，都是生态学可以应用的地方，仅仅就专业而言，我觉得专业不能决定你的就业，还是决定于个人的成就，但是就工作的种类来说，还是略有不同，你可以根据自己对什么更加感兴趣来选择。另外，做研究工作也是一个选择，就我所知，当前对于全球变化的研究是一个比较热点的问题。