《鸣龙少年》的结局是，雷鸣再次一鸣惊人。他被特聘为新校的十一班老师，但招生是一个大难题，没人愿意主动报名。学校为此特意为雷鸣配了心理师桑夏，帮助他教育学生。雷鸣最终说服李燃、程雨杉和其他几位学生加入班级，并通过自己的教育方式提升他们的成绩。
在个人生活中，程雨杉发现继父在房间里安装摄像头后，每天回家都会小心查探，怕被监视。桑夏和雷鸣帮助解决这个问题，让程雨杉没有了后顾之忧。李燃偶然知道了沈耀的秘密，两人成为朋友，但沈耀心理压力太大，多次用自残来缓解压力，对李燃产生了不一样的感情。李燃选择报志愿时和沈耀选择了相对的地方，以免影响沈耀。
高考结束后，程雨杉如愿考上了清北，而李燃也和沈耀坦白了，沈耀也知道这段感情是不对的。最后，沈耀出国深造，李燃考上北方的一所名牌大学。雷鸣的成功也让雷鸣再次一鸣惊人，成为教育界炙手可热的明星教师。
