南京大学最好的专业也是南京最牛的专业共有四个，分别是天文学、地质学、图书情报与档案管理、中国语言文学

1、天文学

南京大学的天文学专业在天文与空间科学学院，该学院的前身是天文学系，为社会培养了众多天文顶尖人才。国内学校的天文学里最有优势的只有南京大学和中国科学技术大学，而南京大学作为这其中的二分之一，天文学学科表现优秀，多次在全国学科评估中获得A+。

2、地质学

南京大学的地质学是A+学科，是国家一级重点学科和江苏省重点建设的优势学科。该专业所在院系是我国最早建立的地质学系，目前也是我国规模最大的地球科学学院之一。该专业曾出现过19位中国科学院地质学部院士，数量位居全国第一。南京大学跟国内外几十所大学和研究机构都建立了广泛的科研合作交流关系，成功主办了一系列国内外学术会议。

3、图书情报与档案管理

南京大学中国社会科学引文索引也是国家和教育部的重点项目，南京大学图书馆、信息和档案管理被评为A+科目。南京大学具有完备的体系和层次，是中国图书情报学人才培养的基地。杰出学者苗权孙、万国定、刘仪征、李晓原、戴志谦、史廷勇、洪友锋等都出自该校。

4、中国语言文学

南京大学的中文系是南京大学历史上最悠久的部门之一，也是南京大学最具实力的学术部门之一，源于1902年创建的三江师范学校。南京大学设有中国语言文学博士后流动站，中国文学工程率先进入“211”工程，并获得首届国家博士学位。同时，中国语言文学在第四轮学科评估中被评为A级学科。